وقتی صحبت از این می‌شود که «چطور این فایل را وارد ChatGPT کنم؟»، معمولاً PDF اولین پاسخی است که به ذهن می‌رسد؛ حتی زمانی که فایل اصلی می‌تواند ساختار بسیار مفیدتری را حفظ کند. PDF در درجه اول برای حفظ ظاهر ثابت یک سند طراحی شده است. اگرچه PDFهای استاندارد می‌توانند برچسب‌ها و ساختار منطقی داشته باشند، خروجی گرفتن از فایل‌های دیگر معمولاً صفحات گسترده و اسلایدها و سایر فایل‌های کاری را به صفحاتی تبدیل می‌کند که تحلیل دقیق آن‌ها دشوارتر است.

در چنین شرایطی، ممکن است ارتباط واضح بین ستون‌های جدول از بین برود، ترتیب خواندن متن‌های چندستونه به‌هم بخورد و فرمول‌ها نیز پشت مقادیر نهایی که نمایش داده می‌شوند پنهان شوند.