فن‌های کیس ممکن است فقط با اتصال به مادربورد شروع به چرخش کنند و ظاهراً همه‌چیز درست به نظر برسد، اما نوع اتصال فن و حالت کنترل آن می‌تواند روی سرعت چرخش، صدای سیستم و عملکرد خنک‌کننده تأثیر مستقیم داشته باشد. نکته مهم این است که ۴ پین بودن هدر مادربورد لزوماً به این معنی نیست که هر فن متصل به آن با PWM کنترل خواهد شد.
در بیشتر مادربوردهای جدید، هدرهای فن از حالت PWM و DC پشتیبانی می‌کنند و برخی مدل‌ها نیز می‌توانند نوع فن را به صورت خودکار تشخیص دهند. با این حال، نحوه عملکرد دقیق هدرها به مدل مادربورد بستگی دارد.