لینوکس به دلیل سیستم مجوزهای پیشرفته، مخازن نرم‌افزاری و سازوکارهای امنیتی خود معمولاً در برابر بسیاری از تهدیدها مقاومت خوبی دارد؛ اما این ویژگی‌ها به معنای مصونیت کامل از ویروس‌ها و بدافزارها نیست. فایل‌های مخرب، بسته‌های آلوده و اسکریپت‌هایی که با دسترسی‌های گسترده اجرا می‌شوند، همچنان می‌توانند اطلاعات کاربران را در معرض خطر قرار دهند. بنابراین، برای افزایش امنیت اوبونتو و سایر توزیع‌های لینوکس، باید علاوه بر ابزارهای امنیتی، به منبع دریافت نرم‌افزار و مجوزهای دسترسی نیز توجه کنید.